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粒子
颗粒膜污染可以定义为悬浮和胶体物质，它们吸收到膜上。固体将堵塞膜，导致需要处理的水不再能够通过。当隔膜被堵塞时，需要更大的压力才能进行常规的水处理。这导致能源成本上升。
缩放比例
结垢是指颗粒在膜上的沉积，导致其堵塞。这是在纳米过滤和反渗透过程中可能发生的不良影响。结垢会导致更高的能耗，并缩短膜的使用寿命，因为它们将需要更频繁地清洁。
纳米过滤和反渗透是通常用于从地下水或地表水制备饮用水的过程。在这些过程中，需要很高的转化率，因为这将限制原材料和能量的损失。根据转化率，大约75％至90％的给水将被转化为所需的产品。
在此过程中，浓缩膜会吸收盐分。不溶于水的无机盐（例如碳酸钙和硫酸钡）可能会变得过饱和。这导致它们沉淀。当转化率高时，水不溶性盐在膜上的沉淀更容易发生。
缩放会使标称通量减小。如前所述，后果是更高的能源消耗，清洁频率的增加和膜的寿命缩短。这将导致膜水处理过程变得更加昂贵。
向系统中添加酸或防垢剂可以防止盐的沉淀。酸可降低碳酸钙的过饱和度，而防垢剂可降低沉淀水平。
膜过滤单元在最大转化率和最小剂量的酸和防垢剂方面表现最佳，而不会发生结垢。
生物污染
被称为生物污染的生物污染最常发生在纳米过滤和反渗透过程中。这是因为膜不能用氯消毒，以杀死细菌。纳滤或反渗透膜中的生物污垢可能是膜系统中发生的污染最少的污染物。这可以归因于微生物细菌的复杂生长。这些微生物对纳米过滤和反渗透系统具有破坏性，通常是不可逆的作用。
膜系统中微生物的种类，生长因子和浓度在很大程度上取决于关键因素，例如温度，阳光的存在，pH，溶解氧浓度以及有机和无机养分的存在。
微生物可以通过水或空气（或两者）进入系统。
好氧（依赖氧气）细菌通常生活在温暖，浅水和阳光充足的水中，具有高溶解氧含量，pH值为6.5至8.5以及大量有机和无机营养物质。另一方面，
厌氧细菌（与氧气无关）通常存在于密闭系统中，几乎没有溶解的氧气，甚至没有溶解的氧气，当存在足够量的养分时就会活跃。这可能是有机物，也可能是死藻的残留物。
两种细菌都可以存在于同一系统中。有些细菌可以在有氧和有氧条件之间切换，反之亦然。它们的性质取决于水的状态。
最丰富的生物污染类型之一起源于反渗透系统的预处理以及可促进藻类生长的部分膜系统。暴露在阳光下或含有静水的膜系统部件可能导致藻类的生长膨胀。
阳光在藻类生长的光合作用过程中起着重要作用。阳光的量决定了产生的氧气量。当给水中的溶解氧含量不足以进行新陈代谢时，需氧细菌依赖于氧气，需要藻类产生的氧气。
藻类死亡后，它们成为细菌的食物来源，因为它们释放出细菌在膜系统中生长所需的有机养分。
膜系统中的另一种生物污损是细菌附着在管道内壁上。角落和死角是细菌可以吸收到的管道中的位置。
细菌吸收到墙壁后，生物膜的第一部分形成。生物膜的尺寸会增加，而细菌会不断繁殖，而死有机物质则会吸收到生物膜结构中。尽管生物膜会影响水流，但它仍会吸引少量的悬浮固体和微生物。生物膜沉积物变成坚固，连贯的整体，很难去除。最终，生物膜的一部分将被释放并通过系统组件（包括膜）扩散。当它们附着在膜上时，微生物会利用给水中存在的营养物开始繁殖。结果，生物膜将在膜上形成，这阻碍了进水流经膜。这导致更高的压力，这导致更高的系统成本和对膜的不可修复的损坏。
甚至会出现某些膜材料是微生物生长的合适环境，这将导致膜在短时间内被完全破坏。
